北京时间5月21日，足协杯第三轮战罢，晋级16强的球队全部产生。16强中，包括12支中超球队、3支中甲球队和1支中乙球队，广西恒宸作为中乙独苗堪称黑马，武汉三镇、梅州客家、深圳新鹏城、长春亚泰4支中超球队被低级别联赛球队淘汰出局。

本轮比赛，16支中超球队全部出场，与第二轮过关的12支中甲球队和4支中乙球队捉对厮杀。大连英博、上海申花、上海海港、山东泰山、北京国安、成都蓉城6支球队都获得了3球及以上的大胜，晋级非常轻松。浙江队、青岛西海岸虽都是小胜，但场面上也占有较为明显的优势。而云南玉昆则是通过补时绝杀，幸运战胜了中乙的定南赣联。河南队与天津津门虎均以一球小胜，但对阵低级别球队，场面上都处于劣势。青岛海牛更是通过点球大战，才勉强淘汰了辽宁铁人。

4支被淘汰的中超球队中，武汉三镇在一球领先的情况下被中甲球队山西联合逆转，全场处于劣势。梅州客家更为丢人，同样是一球领先被逆转，但输给的是中乙球队广西恒宸。后者作为唯一晋级16强的中乙球队，连续战胜中甲、中超强敌，堪称一匹黑马。长春亚泰和深圳新鹏城则都是经过点球大战被淘汰，分别输给了中甲球队大连鲲城、广东广州豹。

根据赛制，从1/8决赛（第四轮）开始，将通过重新抽签确定16支晋级球队的对阵及主客场情况。